正常干细胞及其在许多肿瘤类型中更分化的后代表现出不同的转录组谱，因此表达不同的抗原。众所周知，正常干细胞表达多种可能被宿主免疫系统识别的肿瘤相关抗原的肿瘤相关抗原的不同的子组已经在肿瘤干细胞已经描述，包括：中过表达的抗原被最低限度地通过正常组织中表达，但组成由肿瘤过表达作为其恶性表型的一部分;通常限于成年睾丸生殖细胞的癌症、睾丸抗原和胎盘但在肿瘤中异常激活；源自癌症基因组中体细胞突变的突变抗原，导致免疫细胞可识别的全新表位；特定类型的组织特有的分化抗原，由癌细胞和非恶性细胞共同表达。许多谱系特异性标记被认为是分化抗原。正常干细胞标记在一定程度上。因此，多形性胶质母细胞瘤正常干细胞在共培养中未能引起T细胞介导的反应，实际上抑制了T细胞增殖并诱导其向表型分化。出国看病服务机构发现，自体循环淋巴细胞的实验。该实施例突出了正常干细胞的低免疫原性，并显示了免疫学特征如何指示免疫抑制活性。同样，致癌性黑色素瘤正常干细胞以D86依赖性方式优先抑制白介素2依赖性T细胞活化，并诱导D4、D25、调节性T细胞。在分子上，黑素瘤正常干细胞的黑素瘤相关抗原的水平较低，而刺激分子导致其拥有免疫逃避能力。尽管人们普遍认识到各种类型的癌症中正常干细胞中人白细胞抗原分子和抗原加工机械成分表达缺陷的趋势，但存在争议和矛盾的结果。例如，与非正常干细胞相比，分离为球状细胞的结肠正常干细胞表达较低水平的人主要组织相容复合物I类；从结肠细胞系分离为细胞的正常干细胞则以与主要人群细胞相同的水平表达人白细胞抗原I类。有报道称，分离成球状细胞的多形性胶质母细胞瘤正常干细胞表达高水平的人主要组织相容复合物I而表达低水平的D86和D40，但不表达人主要组织相容复合物II或D80，表明可能缺乏刺激这些正常干细胞中T细胞活化或增殖所必需的抗原呈递能力。关于抗原加工机械基因的表达，从12个人类实体肿瘤细胞系中分离出的正常干细胞球形显示出相同或更高水平的抗原加工机械分子的核糖核苷酸表达，但下调或丢失在10个细胞系中的8个中观察到了球形的人白细胞抗原分子。有趣的是，球体培养的细胞来自人原发性多形性胶质母细胞瘤和结肠癌样品表现出低的或没有抗原加工机械分子表达衍生。总体而言，似乎尽管在不同情况下以一种或另一种方式发生了不同的免疫学特征，但由于人主要组织相容复合物和抗原加工机械均被破坏，抗原呈递功能在正常干细胞中受到损害。有效的抗原呈递所必需的。
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