肿瘤浸润性T细胞

　　认为肿瘤浸润淋巴细胞富含识别共同的肿瘤抗原或突变来源的新表位的T细胞。出国看病服务机构进行了外显子组测序，来自两名肿瘤浸润淋巴细胞显示强肿瘤反应性的人类白细胞抗原A2阳性黑色素瘤患者的肿瘤细胞系的表位预测。使用自体肿瘤浸润淋巴细胞通过免疫测定筛选潜在的新表位以进行识别，并通过泊松检测质谱法在肿瘤主要组织相容性复合物I类分子上呈递。来自患者的肿瘤浸润淋巴细胞分别识别出预测的新表位的5/181和3/49。泊松检测质谱法筛查从第一位患者的肿瘤组织相容性复合物I类上检测到3/181个新表位，但是在肿瘤浸润淋巴细胞识别的那些中也只有一个。因此，尽管被肽激活，但富含新表位特异性的肿瘤浸润淋巴细胞未能识别肿瘤细胞。对于第二位患者，仅在对肿瘤细胞进行干扰素-ｙ治疗后，泊松检测质谱法才能检测到49种预测的新表位中的一种，这与肿瘤浸润淋巴细胞识别出的相同特异性相吻合。重要的是，对于肿瘤浸润淋巴细胞识别或在肿瘤组织相容性复合物I类上检测到的所有新表位，可以从患者和供体外周血单核细胞扩增特异性T细胞。总之，刺激肿瘤内适当的炎性环境可能会促进新表位组织相容性复合物的呈递，而血液中T细胞的扩增可能会避免缺乏特异性肿瘤浸润淋巴细胞。此处揭示的物理方法与功能方法之间的检测差异可以合理化，并可以用于改进靶向新抗原的T细胞免疫疗法。刺激肿瘤内适当的炎性环境可能会促进新表位组织相容性复合物的呈递，而血液中T细胞的扩增可能会避免缺乏特异性肿瘤浸润淋巴细胞。此处揭示的物理方法与功能方法之间的检测差异可以合理化，并可以用于改进靶向新抗原的T细胞免疫疗法。刺激肿瘤内适当的炎性环境可能会促进新表位组织相容性复合物的呈递，而血液中T细胞的扩增可能会避免缺乏特异性肿瘤浸润淋巴细胞。此处揭示的物理方法与功能方法之间的检测差异可以合理化，并可以用于改进靶向新抗原的T细胞免疫疗法。
　　 转移性恶性黑色素瘤患者的肿瘤浸润淋巴细胞被认为富含可识别患者肿瘤表达抗原的T细胞。与此相符，自体肿瘤浸润淋巴细胞的治疗已扩大到离体大量并重新注入黑素瘤患者，可在很大一部分患者中引起长期的临床反应。肿瘤浸润淋巴细胞识别不同类别的肿瘤相关抗原，并且最初的努力集中在患者之间共享的广泛表达的肿瘤相关抗原上。这样的肿瘤相关抗原既包括在正常黑素细胞对应物中发现的分化抗原，又包括通常仅在免疫特权位点中表达的异常表达的抗原，例如癌-睾丸抗原。用T细胞受体转导的T细胞的治疗方法可识别这些类型的共享肿瘤相关抗原，例如NY-ESO-1，MART-1基因表位，gp100和MAGE-A3，已在有限的范围内导致了转移性病变的临床消退治疗的患者的数量，有时有严重的副作用引起的交叉反应性对正常组织。
　　 最近，研究领域的重点已转移到与体细胞突变相关的肿瘤特异性抗原，这在大多数情况下对于每个患者都是唯一的。下一代测序技术的发展推动了这一发展，该技术使得几乎常规地鉴定所有与肿瘤相关的突变成为可能，包括驱动基因和患者独特的突变。突变不是肿瘤发生的一部分，但倾向于在肿瘤进展过程中积累，尤其是在紫外线或致癌物质暴露引起的肿瘤中，通常是黑色素瘤和肺癌。
　　 由突变产生的新表位是有吸引力的癌症免疫治疗靶标。突变在胸腺选择过程中不存在，因此不受中央耐受。因此，新表位被视为“外来”非自我。另外，这些突变确实是肿瘤特异性的，尽管可能会发生与其他蛋白质表位的交叉反应，但发生ON-靶，OFF-肿瘤副作用的风险较小。几条证据表明，新表位频率可以决定患者T细胞排斥肿瘤的能力。因此，在患者的抗体阻断检查点的分子CTLA4和PD-1处理的突变载荷和临床结果之间的关联已经被描述。此外，临床疗效肿瘤浸润淋巴细胞过继细胞疗法和T细胞特异性针对在输注的肿瘤浸润淋巴细胞肿瘤衍生的突变的存在之间的连接已经建议。此外，过继细胞疗法执行与肿瘤浸润淋巴细胞富集特定新表位T细胞已导致成功的临床结果。
　　 在这项研究中，出国看病服务机构使用含有两种肽文库在硅片，从早期传代肿瘤细胞系整个外显子测序数据来自两个人类白细胞抗原-A2来源的T细胞的新表位阳性的黑色素瘤患者。通过质谱法筛选预测的新表位活化功能性自体肿瘤浸润淋巴细胞的能力以及它们在组织相容性复合物I类上的存在。这种组合方法揭示了免疫学和物理检测方法之间的显着差异，泊松检测质谱法无法检测到自体肿瘤浸润淋巴细胞识别的新表位，反之亦然。在这里，将检查这种差异。除了肿瘤浸润淋巴细胞功能测定外，还对泊松检测质谱法的肽回收率和检测灵敏度进行了表征。出国看病服务机构的结果突出了以新表位特异性，基于T细胞的免疫疗法靶向肿瘤时面临的困难，并提出了如何改善此类疗法的策略。