神经胶质瘤的预后因子 |
脑胶质瘤是最常见的恶性原发性脑肿瘤,也是成年人中最致命的脑肿瘤。尽管在手术和辅助治疗的进展,神经胶质瘤的预后仍较差。研究神经胶质瘤的潜在机制对于神经胶质瘤治疗很重要。需要新的靶标以获得更好的抗肿瘤反应。据报道,环状RNA参与了肿瘤的发展。通过其管理职能,circRNAs可以作为在肿瘤进展,这表明circRNAs可能是新颖的生物标志物或靶肿瘤治疗癌基因或肿瘤抑制基因。然而,circRNAs胶质瘤的表达和功能仍然不清楚。
竞争性内源RNA是circRNA功能研究最多的领域。RNA可用作ceRNA,并竞争与共享miRNA的结合。由于其稳定性,主要的细胞质定位和非编码性质,circRNA具有与ceRNA一样的优势。有各种研究报道circRNA作为ceRNA来调节肿瘤的进展。在结肠癌中,circRNACCDC66充当ceRNA来海绵化miRNA,并促进肿瘤的生长和转移。此外,circRNAcircPVT1可以抑制let-7b等多种肿瘤抑制miRNA来抑制衰老。考虑到circRNA在肿瘤中的重要作用,海外医疗网的研究人员被迫调查circRNA作为神经胶质瘤治疗的新型生物标志物或靶标的功能。在这项研究中,对神经胶质瘤组织进行了circRNA微阵列分析,并匹配了正常脑组织样本,以探索神经胶质瘤中circRNA的概况。进行了与circRNA对应的线性mRNA转录本的GO分析,KEGG和Reactom途径分析,以研究所涉及的生物学过程和途径。研究了所选circRNA的临床意义,相关生物学功能和可能的机制。
该研究得到医院伦理委员会的批准,并据《赫尔辛基宣言》进行。参与者提供书面知情同意书。根据医院的机构动物护理和使用委员会的指导,对动物研究进行了批准并进行了相应的研究。从医院收集脑胶质瘤组织和匹配的正常脑组织样本,并进行circRNA微阵列分析。医院采集73例脑胶质瘤组织,进行qRT-PCR。使用CapitalBio将脑胶质瘤组织和匹配的正常脑组织样品进行circRNA微阵列分析。通过GeneSpring软件V13.0分析了circRNA阵列数据。使用CLUSTER软件对结果进行log2转换并以基因为中心进行中位数分析,并通过平均连锁进行层次聚类分析。
通过TRIzol分离RNA。核和细胞质级分通过NE-PER核和细胞质提取试剂分离。使用SYBRP检测试剂盒进行qRT-PCR。引物由Invitrogen合成。胶质瘤细胞系U251和U87购自培养物保藏中心。按照供应商的说明对细胞进行相应的培养。细胞真实性通过DNA指纹图谱验证。使用转染细胞。靶向circCPA4,let-7模拟物和抑制剂的siRNA。转染后48小时,接种细胞,并加入CCK-8溶液。在37°C下孵育2小时后,用Bio-TekEPOCH2检测到450nmol/L的吸光度。接种细胞并孵育2周。然后,将菌落用甲醇固定10分钟,并用0.1%结晶紫染色15分钟。之后,对菌落成像并计数。将细胞接种在迁移室中,并将含10%FBS的培养基添加到下部室中。接种后24小时,用甲醇将侵袭性细胞固定10分钟,并用0.1%结晶紫染色15分钟。之后,对侵袭性细胞成像并计数。将细胞皮下注射到4周龄的裸鼠中。每4天给小鼠注射瘤内注射。28天后,切除异种移植肿瘤并检测肿瘤重量。对于肺转移,通过尾静脉注射细胞。然后,切除肺并在8周后计数转移结节的数目。
将细胞用相应的质粒转染,并使用Lipofec进行let-7模拟。转染后48小时,用双重荧光素酶报告基因分析系统定量荧光素酶活性。使用Lipofect将细胞用MS2bs-circCPA4,MS2bs-circCPA4mt或空白对照MS2bs-Rluc转染。RIP由GFP抗体和Magna结合蛋白免疫沉淀试剂盒进行48小时。为了在Ago2上进行RIP分析,转染后48小时通过抗Ago2抗体进行RIP,并测量了circCPA4,CPA4和let-7的水平。简而言之,蛋白质通过10%SDS-PAGE分离,然后转移至PVDF膜。将膜与5%脱脂奶一起孵育,然后与针对CPA4的抗体孵育,然后与HRP标记的二抗孵育并通过化学发光检测。抗β-肌动蛋白抗体用作对照。使用SPSS19.0软件进行统计分析。使用t检验分析各组之间的比较。使用Kaplan-Meier图和对数秩检验进行生存分析。数据表示为三个独立实验的平均值±SD。P<.05表示具有统计意义。
为了探索circRNA在神经胶质瘤中的潜在参与,对神经胶质瘤组织和匹配的正常脑组织样品进行了高通量circRNA微阵列测定。在神经胶质瘤组织中,至少下调了14754circRNA,上调了13511circRNA。进行与circRNA对应的线性mRNA转录本的GO分析,KEGG和Reactom途径分析。GO分析表明,相应的线性mRNA与细胞运动性和细胞迁移有关。KEGG通路分析表明粘着斑和紧密连接。Reactom途径分析还表明胶原蛋白的形成和细胞外基质的降解。hsa_circ_0082374在神经胶质瘤组织中上调最多,因此研究人员决定研究这种circRNA。Hsa_circ_0082374被认为是通过人类参考基因组衍生自羧肽酶A4的。因此,将hsa_circ_0082374命名为“circCPA4”。为了探讨circCPA4在神经胶质瘤中的临床意义,对73例神经胶质瘤患者进行了生存分析。等于或高于平均水平的CircCPA4表达被认为是“circCPA4高”组。Kaplan-Meier生存分析表明,高水平的circCPA4与神经胶质瘤的不良结局有关。
circCPA4抑制抑制细胞增殖和减少细胞集落形成能力。circCPA4抑制后,侵袭细胞减少。研究circCPA4在体内的功能,研究人员建立小鼠异种移植模型。circCPA4的抑制抑制了肿瘤的生长和肺转移,表明circCPA4的抑制抑制了神经胶质瘤的增殖和转移。CircRNA通过充当ceRNA参与转录控制。circRNA-miRNA网络分析表明,circCPA4具有let-7的结合位点。因此,研究人员探索circCPA4的细胞内位置。发现它主要位于细胞质中,表明circCPA4可能充当miRNA的海绵。因此,研究人员进行荧光素酶报告基因检测,发现在野生型荧光素酶报告基因和let-7模拟物共转染后,荧光素酶活性降低了。为了进一步验证circCPA4和let-7的结合,继续进行RIP分析,发现let-7主要富含MS2bs-circCPA4组,表明circCPA4可以直接与let-7相互作用并充当let-7的海绵。
在Ago2上进行的RNA免疫沉淀分析表明,circCPA4,CPA4和let-7大部分富集到Ago2,这表明circCPA4和CPA4被募集到Ago2相关的RISC中并与let-7相互作用。另外,敲除circCPA4可将Ago2富集减少到circCPA4,但增加Ago2对CPA4的富集,表明circCPA4充当ceRNA并与CPA4竞争与miRNA的结合。此外,对circCPA4的抑制作用会降低CPA4的表达,这可以被let-7抑制剂逆转,这表明circCPA4可以抑制let-7来调节CPA4的表达。接下来,研究人员探讨了CPA4在神经胶质瘤中的临床意义,发现CPA4的高表达与神经胶质瘤的不良预后相关。
最近的研究表明,circRNA在肿瘤进程中起着至关重要的作用,包括细胞凋亡,血管生成和细胞周期进程。circRNAs可以承诺在肿瘤治疗中的预后标志物和治疗靶点。但在神经胶质瘤circRNAs的表达和功能仍然不清楚。一项研究表明,神经胶质瘤中有476多种circRNA差异表达。并发现circ_002136抑制神经胶质瘤的存活,迁移和管形成。在这里对神经胶质瘤组织进行了高通量的circRNA微阵列分析,并匹配了正常脑组织样本,以研究circRNA在神经胶质瘤中的参与。结果显示,在神经胶质瘤中,circCPA4上调最多,而高水平的circCPA4与神经胶质瘤的较差生存呈正相关。此外,circCPA4参与神经胶质瘤的进展,而circCPA4的抑制抑制了神经胶质瘤的增殖和转移。这些结果表明,circCPA4可能是一种新的预后生物标志物和神经胶质瘤治疗的目标。
据报道,circRNA可以作为ceRNA来调节肿瘤的进展。据报道18CircRNAcircHIPK3通过海绵化多个miRNA调节细胞生长。在肝细胞癌中,发现circRNAcircMTO1和cSMARCA5充当miRNA海绵并调节肿瘤的进展。但是,没有这样的研究已经报道了神经胶质瘤。使用circRNA-miRNA网络分析来探索circCPA4的目标miRNA,并发现let-7的结合位点。长期以来,Let-7起到抑癌作用,并参与多个肿瘤过程。Let-7可能影响基因组稳定性,并与抗癌细胞毒性治疗后的存活率有关。然而,它在神经胶质瘤中的作用仍不清楚。let-7抑制了神经胶质瘤中DNA损伤后MDM4的表达。研究人员发现circCPA4可以直接与let-7相互作用并通过使let-7海绵化而起作用。
然后,使用TargetScan探索let-7的潜在靶基因并发现了CPA4。CPA4的异常表达与癌症进展有关。涉及前列腺癌的侵袭性。在胰腺癌中,CPA4明显过表达并且与肿瘤进展和不良预后密切相关。在胃癌中,CPA4高表达,可能是独立的不良预后因素。非小细胞肺癌中,高CPA4表达与不良预后有关,可用于早期发现。在乳腺癌中,据报道CPA4是预后标志物和治疗靶标。胶质瘤中CPA4的表达及其临床意义尚未见报道。这里发现CPA4是let-7的下游目标,并可能受let-7调控。circCPA4充当ceRNA,与CPA4竞争与let-7的结合,从而调节CPA4的表达。生存分析显示,高水平的CPA4与神经胶质瘤的不良结局有关。简而言之,circCPA4在神经胶质瘤中上调,与神经胶质瘤的不良存活有关。CircCPA4可调节神经胶质瘤的增殖和转移,并通过在神经胶质瘤中掺入let-7来调节CPA4的表达。circCPA4轴通过ceRNA机制调节神经胶质瘤的进展,而circCPA4可能是一种新型的生物标记物,是神经胶质瘤治疗的靶标。
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