胶质瘤中核心差异甲基化基因 |
差异甲基化基因通过调节细胞周期,增殖,凋亡,迁移,浸润,DNA修复和信号传导途径在神经胶质瘤的发病机理中起关键作用。这项研究旨在通过全面的生物信息学分析来识别异常D毫克和途径。GSE28094的基因表达谱是从基因表达综合数据库下载的,并且使用GEO2R在线工具来查找D毫克。使用注释可视化和综合发现数据库对D毫克s进行基因本体论功能分析和《京都议定书》基因与基因组通路富集分析。使用搜索工具构建了蛋白质-蛋白质相互作用网络,以检索相互作用的基因。通过Cytoscape软件中的MolecularComplexDetection对PPI网络中的模块进行分析,并执行了四个模块。癌症基因组图谱数据库验证具有高度连通性的中枢基因。总共349个D毫克,包括167个高甲基化基因,丰富细胞增殖的负调控和正调控以及RNA聚合酶II启动子转录的正调控的生物学过程。途径分析的丰富性表明,癌症调节了干细胞的多能性和PI3KAKT信号通路,而182个低甲基化的基因在免疫应答,细胞对脂多糖的应答和肽基酪氨酸磷酸化的生物学过程中富集。途径富集分析揭示了细胞因子-细胞因子受体的相互作用,I型糖尿病和TNF信号通路。
总共鉴定出20个中枢基因,其中有8个与生存相关的基因,包括Notch受体1,SRC原癌基因,白介素6,基质金属肽酶9,白介素10,胱天蛋白酶3,erbb2受体酪氨酸激酶2和表皮生长因子。因此,生物信息学分析确定神经胶质瘤中的一系列核心D毫克和途径。出国看病网研究的结果可能有助于评估神经胶质瘤的致瘤性和进展。此外,重要的D毫克可能为胶质瘤的精确诊断和靶向治疗提供潜在的基于甲基化的生物标记。其中有8个与生存相关的基因,包括缺口受体1,SRC原癌基因,白介素6,基质金属肽酶9,白介素10,半胱天冬酶3,erbb2受体酪氨酸激酶2和表皮生长因子。因此,生物信息学分析确定了神经胶质瘤中的一系列核心D毫克和途径。出国看病网研究的结果可能有助于评估神经胶质瘤的致瘤性和进展。此外,重要的D毫克可能为胶质瘤的精确诊断和靶向治疗提供潜在的基于甲基化的生物标记。其中有8个与生存相关的基因,包括缺口受体1,SRC原癌基因,白介素6,基质金属肽酶9,白介素10,半胱天冬酶3,erbb2受体酪氨酸激酶2和表皮生长因子。因此,生物信息学分析确定了神经胶质瘤中的一系列核心D毫克和途径。
出国看病网研究的结果可能有助于评估神经胶质瘤的致瘤性和进展。此外,重要的D毫克可能为胶质瘤的精确诊断和靶向治疗提供潜在的基于甲基化的生物标记。基质金属肽酶9,白细胞介素10,胱天蛋白酶3,erbb2受体酪氨酸激酶2和表皮生长因子。因此,生物信息学分析确定了神经胶质瘤中的一系列核心D毫克和途径。出国看病网研究的结果可能有助于评估神经胶质瘤的致瘤性和进展。此外,重要的D毫克可能为胶质瘤的精确诊断和靶向治疗提供潜在的基于甲基化的生物标记。基质金属肽酶9,白细胞介素10,胱天蛋白酶3,erbb2受体酪氨酸激酶2和表皮生长因子。因此,生物信息学分析确定了神经胶质瘤中的一系列核心D毫克和途径。出国看病网研究的结果可能有助于评估神经胶质瘤的致瘤性和进展。此外,重要的D毫克可能为胶质瘤的精确诊断和靶向治疗提供潜在的基于甲基化的生物标记。
组蛋白H3K27脱甲基酶Jumonji结构域蛋白3参与体细胞分化和肿瘤进展;然而,JMJD3在癌症进展中的潜在机制尚待充分探索。为了更好地了解JMJD3在脑肿瘤细胞中的功能,出国看病网研究调查了JMJD3对神经胶质瘤细胞上皮-间质转化和迁移的影响,以及涉及CXC基序趋化因子配体的潜在机制12/CXC基序趋化因子受体4轴。胶质瘤样品组织芯片的免疫组织化学染色证实,JMJD3过表达可将高度转移性胶质瘤分层。JMJD3的过度表达诱导了纺锤形的形态,促进N-钙粘蛋白的表达,抑制E-cadherin表达并增强U-251毫克和U-87毫克美国典型培养物保藏中心细胞的迁移能力。通过蛋白质印迹和逆转录定量聚合酶链反应评估E-cadherin和N-cadherin的表达,并使用Transwell迁移分析和伤口愈合评估细胞迁移。JMJD3的过表达以脱甲基酶活性依赖的方式上调了CXCL12的表达,因为ChIP分析显示在U87毫克ATCC细胞中JMJD3的过表达后,CXCL12启动子处的H3K27三甲基化降低。因此,CXCL12的过表达足以挽救JMJD3抑制对神经胶质瘤细胞EMT和迁移的抑制作用。此外,CXCR4的表达不受JMJD3的调节,但是由CXCR4抑制剂AMD3100引起的CXCR4中断消除JMJD3对神经胶质瘤细胞EMT和迁移的促进作用。总的来说结果表明JMJD3通过CXCL12/CXCR4轴促进了神经胶质瘤细胞的EMT和迁移。出国看病网研究描述调控肿瘤细胞EMT和迁移的新型表观遗传机制,并为神经胶质瘤的诊断和治疗提供了新的方向。
较长的非编码RNAAWPPH也称为microRNA-4435-2HG,与肝细胞癌患者的预后差有关,并已证明可促进HCC和膀胱癌的发展。出国看病网研究旨在探讨lncRNAAWPPH在脑胶质瘤中的作用。通过逆转录-定量聚合酶链反应检测从胶质瘤患者获得的肿瘤组织以及从胶质瘤患者获得的血浆样品和健康对照中AWPPH的表达水平。通过酶联免疫吸附测定法测量血浆转化生长因子-B1的水平。将AWPPH表达载体转染到人脑胶质瘤中细胞系。随后,分别通过Transwell迁移和侵袭分析评估癌细胞的迁移和侵袭。通过Western印迹分析检测TGF-B1在转染的神经胶质瘤细胞中的表达。已经确定,转移性脑胶质瘤患者肿瘤组织中AWPPH表达水平较高;然而,在不同肿瘤大小的患者之间,AWPPH表达没有显着差异。胶质瘤患者血浆AWPPH水平与TGF-B1水平呈正相关但健康对照者则不然。另外,AWPPH的过表达增强了癌细胞的迁移和侵袭,并上调了TGF-B1的表达。TGF-B1处理对AWPPH表达无明显影响。然而,TGF-B抑制剂减弱了AWPPH过表达对细胞迁移和侵袭的影响。因此,出国看病网研究提出AWPPH可能通过激活TGF-B途径促进神经胶质瘤细胞的迁移和侵袭。
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