不同突变和耐药性的稳定性研究

　　肺癌是癌症死亡的主要原因。表皮生长因子受体中的缺失突变对40％的非小细胞肺癌负责。但是，有70％的NSCLC活跃患者在接受一线EGFR酪氨酸激酶抑制剂治疗后获得了T790M耐药性突变。有许多第三代EGFR-TKI，它们具有EGFR突变选择性，可以治愈患有T790M耐药性突变的患者。奥西替尼是第三代EGFR TKI之一，在T790M突变后不可逆地抑制EGFR活性。不幸的是，尽管最初的反应令人印象深刻，但在诊断为第三代EGFR-TKI的15例患者中，有6例会产生新的耐药性，最常见的是外显子20的C797S突变。已为患有C797S第二耐药突变的患者实施了多种治疗技术，但尚未发明正式的第四代EGFR TKI。在出国看病服务机构的研究工作中，出国看病服务机构根据还原和氢键分析了每个结构的稳定性变化。出国看病服务机构的发现提供了通过稳定性检查方面的不同EGFR结构中氢键分析机制的多样性的见解，并强调了治疗剂和第四代TKI克服EGFR C797S仲裁的耐药性的必要性。
　　 高达60％的肺癌患者中存在EGFR基因的不同突变。认识到高效EGFR酪氨酸激酶抑制剂的知识和发展已经推翻了诊断这种普遍恶性肿瘤的过程。经过认证的三代EGFR TKIs可用于治疗EGFR突变阳性的非小细胞肺癌患者。第一代药物是吉非替尼，艾克替尼和厄洛替尼。第二代药物是afatinib和dacomitinib；osimertinib是著名的第三代TKI之一。与基于铂的化疗和第一代TKI相比，第二代TKI已证实具有显着的效率，在应答水平以及无进展生存期和总生存期方面均有显着改善。来自许多研究的数据得出结论，阿法替尼是第二代TKI，在常规临床实践中非常有用且经久耐用，并且对几种罕见的EGFR突变也有益。这些突变主要发生在EGFR外显子18-21区域，其中80％以上是点突变和缺失，其中EGFR的746位至750位的五个氨基酸被删除。这些突变增强激酶活性并触发EGFR过表达，并最终导致肺癌。所述del_E746-A750突变的肺癌患者经历不同种处理过程的，这取决于肺癌阶段。这些突变对第二代EGFR酪氨酸激酶抑制剂afatinib的反应非常好，但是在中位10-12个月后，有70％的NSCLC患者发生了新的耐药突变T790M，第790位的苏氨酸被突变蛋氨酸。医生通常会在那时改变治疗方式，并向患者引入第三代TKI。
　　 当前，许多正在进行的研究集中在计算生物学和生物信息学领域，以研究NSCLC的后果。考虑到许多优势，例如低成本，简单的实现以及处理大量数据集的潜力，计算生物学的技术被有利地用于这些研究中。这些非临床研究方法提供了不俗的业绩，帮助医生对创新的一种更好的方法来提高患者的存活率。如果要研究引起肺癌的EGFR稳定性破坏的化学和生物学特性，出国看病服务机构必须了解突变发生位点的多样性及其随时间的演变。因此，在这项研究工作中，出国看病服务机构首先考虑了野生型EGFR结构，然后在其上应用了del_E746-A750缺失突变并创建了第二个结构，然后将其与afatinib结合在一起，然后形成了另一个结构， ，出国看病服务机构在其上应用了T790M突变并获得了第四个结构，然后将奥西替尼与耐药性结构共价键合，得到了第五个结构，最后，在其上应用了C797S突变以获得了最终结构。使用PyMOL 应用所有突变，出国看病服务机构使用PDB库获得所需的蛋白质文件。
　　 接下来，出国看病服务机构对所有六个结构进行了分子动力学模拟。分子动力学模拟是了解蛋白质功能的最广泛采用的技术之一。在更新的体系结构由于使用分子动力学模拟突变原子信息目前在实践中的方法。基本上，MD模拟可以解释蛋白质中每个原子的牛顿运动方程式，并在给定蛋白质内部原子的主要排列的情况下，在每个时间级别上重新生成它们的位置。在模拟之后，出国看病服务机构从MD模拟中获得的信息称为MD轨迹，有助于对蛋白质功能进行全面的逐步描述，该蛋白质功能按模拟执行的定义的时间步数排列。足够长的MD轨迹也可以告诉出国看病服务机构有关远距离运动的准确数据和时标。它还提供有关溶剂运动及其对蛋白质功能影响的信息。因此，MD模拟是了解蛋白质动力学和功能的非常有用的工具。
　　 本文在对这六个结构进行了深入研究之后。从MD模拟用的诱变实验六个结构进行的决策的结果的观察解释了氢键分析技术可以在它们之间的稳定过渡分类 。出国看病服务机构已经观察到在EGFR中发生突变时氢键数量的减少。药物在第三和第五结构中的存在有助于重新获得失去的氢键，但增加了稳定性，但是在最后一次C797S突变后，该结构达到了所有结构中最不稳定的阶段。
　　 从使用CPPTRAJ进行的最初氢键分析，已经注意到，当野生型EGFR结构变为E746-A750突变时，氢键的数量减少。接下来，当出国看病服务机构添加第二代药物时，氢键数增加。目前，该药物对患者的作用非常好，但是在一段时间后，当出现第一个耐药性时，出国看病服务机构注意到氢键的数量再次减少，而阿法替尼在此阶段不起作用。因此，出国看病服务机构推出了第三代TKI，并明显增加了氢键的数量。
　　 同样，当50％的患者出现第二次耐药性时，氢键数再次减少。显示了氢键如何随框架变化，并标记了每种结构的趋势线。在表II中，出国看病服务机构显示了MD模拟的200帧中不同结构的氢键平均值。与疏水基团不同，氢键具有特定的方向并且不可互换。如果氢键基团改变为另一个氢键基团，则它不可能具有相同的取向，因此，它不可能赋予蛋白质相同的结构或允许相同的催化活性。出于这个原因，由于这种几何约束，出国看病服务机构可以狭义地说氢键对突变不很强。
　　 氢键对蛋白质的稳定性评估至关重要。突变后，野生型结构变得更加灵活，从而带来了结合位点的差异。这种差异降低了结合亲和力并使蛋白质变得具有耐药性。在这项研究工作中，出国看病服务机构考虑了EGFR蛋白的六个阶段，并根据每个结构的氢键变化计算了它们的稳定性。出国看病服务机构可以从这项研究工作中得出两点结论。首先，在所有结构中，C797S突变结构的稳定性最低，因为在这种情况下，氢键的数量最少。其次，药物通过在结构的受体和供体之间建立更多的氢键，使结构稳定。选择这两种药物而不是其他药物至关重要，因为这两种药物是著名的药物，非常适合大多数患者。很少有研究表明，如果结构变得更稳定，那么发生下一个突变的机会就会减少。因此，如果出国看病服务机构可以制造出能够帮助增加结构稳定性的第四代药物，那么其进一步突变的可能性就较小。这项研究成果可以帮助产生新颖的TKI，并且通过现代技术，出国看病服务机构需要增强EGFR-药物复合物的稳定性，以克服或减少耐药性的影响。如果出国看病服务机构能够制造出有助于增加结构稳定性的第四代药物，那么其进一步突变的可能性就较小。这项研究成果可以帮助产生新颖的TKI，并且通过现代技术，出国看病服务机构需要增强EGFR-药物复合物的稳定性，以克服或减少耐药性的影响。如果出国看病服务机构能够制造出有助于增加结构稳定性的第四代药物，那么其进一步突变的可能性就较小。这项研究成果可以帮助产生新颖的TKI，并且通过现代技术，出国看病服务机构需要增强EGFR-药物复合物的稳定性，以克服或减少耐药性的影响。