目前，干扰素-α（IFNα）和核苷（t）ide类似物（NAs）是批准用于治疗慢性乙型肝炎的两大类药物.IFNα具有免疫调节活性，可导致更高的HBeAg血清转换率和HBsAg消失。与IFNα治疗可以显著降低总体发病率HCC持续应答，尤其是亚洲人。IFNα可用于精心挑选的代偿性肝硬化患者。它最适合年轻患者，特别是具有基因型A感染的HBeAg阳性患者。然而，对于失代偿期肝硬化患者禁用脓毒症和肝功能衰竭是禁忌的。它也不用于慢性乙型肝炎或急性肝功能衰竭严重恶化的患者，以及接受免疫抑制或癌症化疗的患者。基于IFNα的治疗的主要优点包括治疗持续时间短和一旦实现持续的治疗后反应。然而，实现反应和高成本以及副作用的可能性低可能限制其长期临床使用。与未治疗的患者相比，用NAs治疗也可以导致HCC发病率显着降低，但它并不能完全消除HCC的风险，特别是在患有既往肝硬化的患者中。因此，患有慢性乙肝需要小心肝癌晚期监视，甚至当他们正在接受抗病毒治疗。NA治疗的另一个缺点是长期连续治疗过程，导致抗病毒药物耐药性。治疗的选择应考虑最初的HBV-DNA水平，HBV基因型/亚基因型，患者年龄和NA治疗的任何禁忌症。NA最适合患有失代偿性肝病或IFN禁忌症的患者，以及愿意长期治疗的患者。治疗应该由具有高抗性遗传屏障的NA（即，耐药性的低潜力）开始。
　　 目前有两种形式的IFNα：常规IFNα和聚乙二醇化长效制剂（PEG-IFN）。PEG-IFN的引入主要影响耐受性。与常规IFNα给药的每日或三次/周时间表相比，它允许每周注射，同时保持相似的抗病毒效力。常规IFNα治疗患者的长期随访显示，与无应答者相比，应答者的失代偿性肝硬化或肝癌晚期发生率降低，总体生存率提高。对HBeAg阳性肝炎患者的PEG-IFN进行的回顾性分析显示，与治疗反应相关的因素包括高ALT，低HBVDNA，女性，年龄较大以及之前没有IFN治疗。结果最好的患者是基因型A和高ALT或低HBVDNA的患者，以及基因型为B或C且ALT高和HBVDNA低的患者。最近对14项试验的荟萃分析表明，PEG-IFN促进慢性乙型肝炎患者的HBsAg清除或血清转换。根据在完成1年PEG-IFN疗程后24周进行的评估，大约30％的HBeAg阳性患者达到HBeAg血清转换和检测不到的血清HBVDNA，15％的HBeAg阴性患者ALT水平正常化。与安慰剂相比，1年的PEG-IFN治疗疗程导致HBeAg血清阳性患者的HBVDNA下降更多（32％对11％）。一项大型研究通过比较233例IFNα治疗患者和233例匹配良好的未治疗对照组和15年随访结束时的累积发生率（中位数6。8年，范围1.1），评估了IFNα治疗HBeAg血清阳性患者的长期预后。在IFNα治疗的患者中与对照组相比：-16.5岁：HBeAg血清学转换率为74.6％vs51.7％（P=0.031）;HBsAg血清清除率3％vs0.4％（P=0.03）;肝硬化17.8％vs33.7％（P=0.041）;和HCC2.7％vs12.5％（P=0.011）。另外一项荟萃分析显示，在12项研究中共收集了2742名受试者，表明IFNα治疗患者的HCC风险降低了34％（RR=0.66,95％CI：0.48-0.89），且益处更为显着在早期肝硬化患者中，与没有肝硬化的患者相比。这些数据表明IFN的主要优点是持久的给药过程和高HBsAg消失率和HBeAg血清转换率，特别是具有基因型A感染的HBeAg阳性患者与感染其他HBV基因型的患者相比。然而，应密切监测IFNα的不良反应，包括初始流感样疾病，疲劳，骨髓抑制和自身免疫性疾病的恶化。
　　 已批准用于治疗慢性乙型肝炎的五种NAs：拉米夫定，阿德福韦酯，替比夫定，恩替卡韦和替诺福韦地索普西。研究人员总结了每个NA的利弊表治疗慢性HBV感染的。
　　 对于对IFNα无反应的患者，优选口服序贯NAs治疗，因为其可预测的功效和最小的副作用。已经证实，1年的NA治疗过程导致血清HBVDNA检测不到率，ALT水平正常化和肝功能增加，但HBeAg阳性或阴性的慢性乙型肝炎患者HBsAg丢失率低。将NA治疗时间延长至1年以上可使HBeAg血清学转换率提高至40％-50％，但HBeAg阳性慢性乙型肝炎患者治疗5年后HBsAg丢失率仍低于10％。在一项随机对照试验中，将651名患有代偿性肝病的HBsAg阳性患者分为两组：接受100mg/d拉米夫定（n=436）或接受安慰剂（n=215）。拉米夫定组中HCC发生率为3.9％，安慰剂组为7.4％（HR=0.49,95％CI：0.25-0.99，P=0.047），中位治疗时间为32.4个月（范围从0到0）42mo）。汇总5项研究（n=2289）的荟萃分析比较了NA治疗患者和非NA治疗患者的HCC发生率。结果发现，治疗组HCC发生率降低了78％（RR=0.22,95％CI：0.10-0.50），尤其是HBeAg阳性患者。同样，最近的一项荟萃分析汇总了3881例NA治疗患者和534例未治疗对照的21项研究，结论NA治疗与HCC发病率较低有关（2.8％vs6.4％，P=0.003）。
　　 目前批准的NAs主要通过抑制前基因组HBVRNA逆转录到HBVDNA的第一链而不是直接抑制cccDNA起作用。因此，治疗后病毒复发很常见。此外，在NA治疗的前12-24周期间血清HBVDNA水平的不足或缓慢下降与持续治疗期间抗病毒药物抗性的风险增加相关。接受耐药基因障碍较低的NA的患者，如拉米夫定和替比夫定，如果初始病毒下降不充分，应接受额外治疗，而接受具有高抗性遗传屏障的NA的患者，包括恩替卡韦和替诺福韦地索普西，可能仍然存在在相同的药物，如果血清HBVDNA水平继续下降。