慢性丙型肝炎病毒感染常导致肝硬化和肝癌晚期。2015年，估计有7100万人患有慢性HCV。尽管在过去几十年中，世界上许多地方的感染率已经下降，但在美国，2010年至2014年间HCV感染的发病率翻了一番，这主要是由于静脉注射毒品的使用增加。批准直接作用抗病毒治疗是消除HCV的必要组成部分，但治疗的固有障碍（例如，成本，缺乏医疗保健，坚持治疗，抵抗等）可防止感染率的显着改善。有效的HCV疫苗将显着减缓疾病的传播。开发HCV培养模型系统和正确折叠和天然修饰的HCV包膜糖蛋白E1和E2的表达的困难阻碍了疫苗开发工作。最近对这些蛋白质的结构和生物物理研究表明，细胞受体CD-81和中和抗体的结合位点本质上是高度灵活的，这使疫苗设计复杂化。此外，整个HCV感染中E1和E2之间的相互作用知之甚少，并且结构灵活性可能在感染期间屏蔽抗原表位中起作用。在这里，我们讨论HCVE1和E2的结构复杂性。最近对这些蛋白质的结构和生物物理研究表明，细胞受体CD-81和中和抗体的结合位点本质上是高度灵活的，这使疫苗设计复杂化。此外，整个HCV感染中E1和E2之间的相互作用知之甚少，并且结构灵活性可能在感染期间屏蔽抗原表位中起作用。在这里，我们讨论HCVE1和E2的结构复杂性。最近对这些蛋白质的结构和生物物理研究表明，细胞受体CD-81和中和抗体的结合位点本质上是高度灵活的，这使疫苗设计复杂化。此外，整个HCV感染中E1和E2之间的相互作用知之甚少，并且结构灵活性可能在感染期间屏蔽抗原表位中起作用。在这里，我们讨论HCVE1和E2的结构复杂性。
　　 丙型肝炎病毒（HCV）呈现轻微症状;作为一种在几周内消退的急性疾病;或终身慢性感染，可导致肝硬化，肝癌晚期，如果不及时治疗，可导致死亡。慢性HCV感染引起的肝癌晚期是美国肝移植的主要原因。根据世界卫生组织的数据，2015年世界范围内有175万新的HCV感染和7100万人患有慢性HCV感染。静脉注射毒品和不安全的医疗保健措施是导致大多数新感染的原因，这对HCV的倍增造成了重大影响。发生在美国2010年和2014年之间。
　　尽管对HCV几个直接作用的抗病毒（DAA）的治疗FDA的批准具有非常高的成功率（>90％）的所有基因型，许多高危人群仍然传播感染速度比它们被固化。慢性HCV患病率约占世界总人口的1％，但在许多医疗保健无法普及的地区则要高得多。例如，蒙古，乌兹别克斯坦，埃及和加蓬的HCV感染率为4％至7％，尼罗河三角洲和上埃及的特定人群感染率高达28％，根据社会经济状况而有很大差异。。埃及最贫穷和受教育程度最低的人群的HCV感染率最高，根本没有接受治疗的手段。此外，静脉注射药物占新HCV感染的约23％。全世界静脉注射吸毒者的人群必须克服一些治疗障碍，例如高成本，获得医疗保健，遵守规定以及害怕被发现为吸毒者。然而，在成功的治疗过程之后，如果患者继续从事危险行为，他们仍有再次感染的风险。这些因素阻止了全世界HCV感染率的显着改善。因此，如果没有有效的疫苗，DAAs似乎不可能单独消除HCV感染。
　　HCV是包含正义单链RNA基因组的包膜病毒。源自宿主膜的脂质包膜嵌入两种I型跨膜蛋白，即包膜糖蛋白E1和E2，它们形成异二聚体。HCV颗粒唯一地与脂质和载脂蛋白,从而起到适当的形成中起作用和分泌的病毒体。这些关联使病毒颗粒具有整体低浮力密度。E1/E2异二聚体负责从识别宿主细胞受体到膜融合的病毒进入。最初的宿主-病毒附着相互作用是通过糖胺聚糖和低密度脂蛋白受体。几个受体在条目诸如紧密连接蛋白1，闭合蛋白，CD81，和清道夫受体B类1型的必要作用，主要通过与E2相互作用，虽然E1的作用尚不完全清楚。E1和E2位于病毒体表面，可用于宿主免疫识别，是免疫原性研究的理想选择，最终导致疫苗设计;然而，在病毒组装，宿主细胞附着和膜融合的各个阶段中,E1/E2异二聚体的构象及其相互作用尚未得到很好的表征。直到最近，已证明高质量，完全糖基化和二硫键连接的包膜糖蛋白难以大量生产用于生物物理研究。
　　 E1的入口，出口，以及免疫逃逸过程中的确切作用（S）没有完全理解。它具有约160个氨基酸的N-末端胞外域，并且作为三聚体存在于细胞培养物产生的HCV颗粒的表面上，由E1C-末端跨膜区域中的相互作用驱动。E1可以在识别肝细胞的相互作用通过与载脂蛋白，载脂蛋白E尤其，这进一步早期附着（在与细胞表面的硫酸肝素相互作用帮助）。通过X射线晶体学确定HCVE1（nE1）的N-末端79个氨基酸的结构数据。该结构显示共价连接的，域交换的同型二聚体，其中nE1形成16个氨基酸的α-螺旋，其侧翼为N-末端β-发夹和C-末端的三链反平行β-折叠。E1的N末端不像假设的II类融合蛋白，或任何其他融合蛋白构象，尽管具有融合肽样结构域;然而，公开的结构可能处于融合后构象，因为晶体是在低pH下获得的。交叉中和抗E1抗体IGH526显示与α-螺旋表位（残基314-324）结合，预测在分子动力学模拟中具有高度灵活性。这是所描述的第一个E1抗原表位结构，并可能有助于未来的疫苗设计。