HCV被分类为七个基因型和流行病学研究表明，感染基因型1b和3与显影HCC[的风险增加相关联。报道指出，丙型肝炎病毒核心基因变异在谁已经解决了感染[HCC患者相关的表明，病毒因素影响进展性肝病。CHC通常与胰岛素抵抗有关，以及核心蛋白已显示dysregulate葡萄糖稳态，导致肝内脂质积聚和脂肪变性。最近的一项研究强调了核心通过削弱线粒体自噬来诱导线粒体损伤的新作用。由此产生的氧化应激被认为是HCC发生和发展的关键触发因素。HCV核心转基因小鼠的体内研究证实了肝脏诱导的HCC中氧化/抗氧化状态的不平衡。HCC表现出高度的遗传异质性，表明基因组稳定性降低，并且ROS的HCV诱导可能引起DNA损伤。一些研究报告说，丙型肝炎病毒核心或NS5A的蛋白质增加活性氧和促进两小鼠模型和氧化应激的体外培养系统。进一步的研究报告，HCV感染降低宿主细胞经由ATM激酶的扰动来检测和修复受损的DNA的能力。这些研究的生理相关性很难证明感染肝脏中病毒蛋白的低水平表达妨碍了确证研究。HCC与多灶性，遗传上不同的肿瘤的发展有关，这些肿瘤提示影响整个肝脏的田间缺陷;然而，创始人细胞的性质知之甚少。一个有趣的问题是HCV是否可以在异常肝细胞中复制，并与癌症进展早期出现的突变协同作用。据报道，与邻近的非肿瘤组织相比，HCC中HCVRNA水平降低，并且观察到HCC肝脏中病毒遗传多样性增加，支持了肿瘤中HCV复制受到限制和区室化的模型。相比之下，有些人报道了使用超深度测序技术的终末期肝病中HCV肝内区室化的有限证据。这些研究强调了进一步研究病毒多样性，宿主免疫反应和肝脏“系统地理学”之间关系的必要性。
　　 致癌病毒的共同特征是它们通过失活宿主肿瘤抑制因子如视网膜母细胞瘤（Rb）蛋白来增加细胞增殖的能力，所述视网膜母细胞瘤（Rb）蛋白抑制S期进入细胞周期所必需的E2F转录因子。HCV编码的聚合酶NS5B已报道结合RB，经由主机泛素连接酶E6AP[诱导其降解，促进宿主细胞增殖。最近的一项研究表明，NS5B可促进NORE1A肿瘤抑制因子的降解，HCV复制的一个重要因素，突出了病毒-宿主细胞相互作用的复杂性。p53蛋白是一种重要的肿瘤抑制因子，可协调细胞周期停滞和对DNA损伤及其他应激的细胞凋亡反应，并且在HCC中经常观察到p53突变。大量报道显示HCV蛋白核心，NS3和NS5A可与p53相关;然而，这些相互作用对p53活性的功能性后果由于观察到这些研究中使用的最容许的HCV复制靶细胞表达突变的无活性p53而变得复杂。最近的一项研究报道，HCV通过感染细胞中NLRP3炎性体的激活诱导caspase-3介导的细胞凋亡，并在感染细胞和未感染细胞中诱导细胞凋亡，为HCV在感染和未感染的旁观者细胞中诱导肝细胞损伤提供了新的途径。尽管讨论了HCV感染的许多潜在致癌特征，但重要的是要注意，在没有肝硬化的情况下，HCC很少发生在CHC中。在晚期纤维化或肝硬化中，HCV基因型3感染和胰岛素抵抗仍然是即使在通过抗病毒治疗消除病毒后增加HCC风险的重要决定因素。HCV感染由宿主病原体相关分子模式受体感知，其诱导干扰素（IFN）和局部炎症反应。HCV已经进化出多种机制来拮抗这些早期宿主的免疫反应。大多数受感染的个体发展为慢性免疫介导的炎症，伴随着肝细胞破坏和再生的重复循环，这被认为是肝癌晚期的关键驱动因素。活化的炎症细胞释放ROS并诱导脂质过氧化，从而促进促癌症环境。实际上，大多数HCV相关的HCC在晚期纤维化和肝硬化的背景中发展的观察支持了该癌症中宿主炎症反应的作用。
　　 发现识别将发展为HCC的患者的算法将增加研究人员对治疗和预防HCC进展的理解。最近的转录组荟萃分析包括超过500个肝硬化人类肝脏，证明了驱动HCC风险的全球调节基因模块，并将溶血磷脂酸（LPA）途径确定为中心化学预防靶点。LPA是一种多效脂质分子，对细胞生长和运动具有强大的作用，新出现的数据突出了淋巴细胞归巢和炎症的重要作用。LPA信号传导的药理学抑制减少了肿瘤生长。一项独立研究证实，HCV感染增加了自分泌运动因子和相关的LPA表达，并报道了LPA促进HCV复制的作用，为HCV提供诱导可能是致癌基因的促炎信号的途径。细胞重编程的一种潜在介质是转录的可遗传（表观遗传）调节，例如DNA甲基化。与慢性炎症相关的肿瘤经常表现出DNA甲基化模式的改变，包括HCC。最近的一项研究表明，HCV感染的嵌合小鼠中多种基因的DNA甲基化增加，这些小鼠具有依赖于NK细胞活性的人源化肝脏，证明了病毒诱导的免疫应答在调节肝细胞甲基化状态中的作用。有的人报道了与肝癌晚期相关的基因附近的增强子的DNA甲基化和HCV相关HCC中的干细胞发育，突出了HCV影响转录因子与基因组中同源位点结合的作用。表示HCV报告可以稳定低氧诱导因子1α，调节血管内皮生长因子的转录因子，提供了额外的路径用于HCV到dysregulate的肝细胞转录，并通过调节上皮-诱导去分化-间质转化。
　　 微小RNA（miR）是小的非编码RNA，其调节多种细胞功能，包括细胞增殖，分化和凋亡。最近的报告突出miR的异常表达在肝组织从与肝病和HCC[主体，以及用于生物标记物的发现为病毒相关HCC[早期诊断提供令人兴奋的可能性]。对于CHB，据报道多种miR的异常表达与HCC发展有关。MIR196A2多态性与男性中国人群中HBV相关性HCC易感性相关。HBx表达可能通过上调HBxAg上调基因11（URG11）来改变多种miR的表达，从而对DNA修复和肿瘤抑制因子产生负面干扰。HBx-和URG11诱导的miR-148a上调已被证明通过抑制磷酸酶和张力蛋白同源物来促进细胞周期进程和细胞迁移，从而增加AKT（也称为蛋白激酶B）-mTOR（雷帕霉素的哺乳动物靶标）信号传导。改变了miR-122a表达抑制HBV复制，通过影响细胞周期蛋白G1表达改变细胞周期并抑制p27的表达。HCV感染调节几种miR的表达，包括miR-146a-5p，miR-196a和miR-135a-5p，其调节代谢途径和肝癌晚期发生。肝脏特异性miR-122的表达水平与非病毒来源的HCC呈负相关，但在HCV-HCC中仍然是保守的。由于miR-122是HCV复制所需的关键宿主因子，因此这支持了一种模型，其中起始细胞的HCV感染可能在癌发生过程中起重要作用。
　　 目前，还没有消除HBV感染的疗法。IFNα可以在3-15％的患者中治愈CHB，但是具有严重的副作用并且很少使用。Nucleos（t）ide类似物（NAs）在超过95％的治疗患者中抑制逆转录并限制HBV复制，并减少肝脏炎症，疾病进展和HCC风险。然而，这些药物对病毒cccDNA或整合拷贝数没有影响，需要长期给药。目前的指南建议仅在血清HBV-DNA水平大于103拷贝ml-1（即大于2000IUml-1）时进行抗病毒治疗已经诊断出血液或晚期纤维化中转氨酶活性增加所表明的显着炎症活性。系统评价显示接受NA治疗的CHB患者在46（32-108）个月期间HCC发病率降低50％以上（分别为治疗和未治疗患者的2.8％）（p=0.003）。作者得出结论，治疗并不能消除HCC的风险。特别是，肝硬化，基线时HBeAg阴性和未能保持病毒学缓解与治疗患者中HCC风险增加有关。进一步的研究证实，慢性乙肝患者依然面临风险肝癌晚期的发展尽管抗病毒治疗。在感染过程中早期已经观察到HBV整合和克隆性肝细胞增殖，并且可能是治疗开始后某些持续性HCC风险的原因。这可以作为早期治疗的理由，而不是现行指南所建议的。为了避免副作用，降低成本并最小化选择用于长期NA治疗的抗性病毒变体的风险，然而，这将需要治疗性治疗方法。使用基于IFN疗法的几项研究报道了持续病毒学应答（SVR），即成功的抗病毒疗法根除HCV，独立地减少纤维化分期肝癌晚期的风险。在平均10年的随访期间，抗病毒治疗后患有SVR的患者发生HCC的发生率为2.5％，而自发性HCV清除后的发生率为1.6％，这取决于纤维化阶段。最近的一项多中心研究报道，在SVR后，肝硬化患者发生HCC的风险为每年1％。在法国HCV感染的肝硬化患者平均51个月的前瞻性研究中，非SVR是50岁后HCC发生的主要决定因素，过量饮酒，血小板计数低和增加γ-谷氨酰转肽酶。
　　在2013年批准核苷酸NS5B聚合酶抑制剂sofosbuvir后，HCV的治疗选择在过去5年发生了巨大变化，结果显示与IFN联合使用时SVR率大于95％。从那时起，新的直接作用抗病毒（DAA）疗法已经可用，副作用明显减少，几乎所有HCV基因型治疗8至12周后，SVR率显着超过90％。最近的研究数据引发了关于DAA治疗和SVR与历史IFN治疗对照相比，先前但成功治疗的HCC可能更高复发的讨论。基于DAA的SVR后HCC风险的数据仅作为回顾性或观察性研究存在，随访1年。这些研究报告的3-5％以下成功DAA治疗的HCC年发病率，这比患者为基础的治疗IFNSVR[以前的报告更高的。然而，这些研究缺乏对照组，这使得最近关于基于DAA的SVR和HCC风险的报告难以解释。一项法国前瞻性队列研究显示缺乏DAA对HCC复发的影响的证据（80％肝硬化，189例患者达到DAA为基础的SVR，20个月随访后HCC复发率约为12％）。需要进行随机对照试验，以阐明目前正在进行的辩论，并可能回答DAA诱导的SVR后HCV特异性免疫应答下降对潜在增加转化细胞生长和HCC复发/发展风险的潜在作用。。然而，很明显，即使成功的CHA治疗CHC也不能消除高级纤维化或肝硬化发生后HCC的风险。基于DAA和IFN的治疗方案显示，HCV治愈后HCC的风险显着降低，但仍存在风险（0.33％/年），并强调了肝硬化发生后监测的重要性，无论治疗反应如何。然而，在可以获得新DAA疗法的国家，高比率的SVR和根除HCV将对肝硬化以及未来十年的HCC发病率产生巨大影响。