除了对肝细胞癌治疗干预的潜在分子靶标进行广泛研究之外，同时确定可靠的生物标记物以便在其早期阶段进行准确诊断，预测复发和治疗反应以及确定预后也可能对改善患者预后有显着影响。在不远的将来。
　　众所周知，肝细胞癌表现出特殊的遗传复杂性和分子异质性，其特征是遗传和表观遗传改变的积累。然而，从慢性肝病进展为良性前体增生和发育不良结节的关键分子驱动因素，以及最后转变为肝癌晚期仍然知之甚少。由于缺乏可靠的生物标志物，早期肝细胞癌的诊断目前具有挑战性。最近，整个转录组分析已经确定了区分肝硬化结节，发育不良结节和早期肝细胞癌的生物标志物，这些生物标志物的潜在可用性可能会提高肝癌晚期在未来的诊断准确性。虽然在早期疾病中使用手术切除，局部治疗和肝移植似乎已经确立，但仍不清楚哪些患者会从这些方式中获益最多。考虑到切除术后的高复发率，尚不清楚一部分切除患者是否实际上可以从肝移植中获益更多。可以想象，用于早期和晚期复发的生物标志物的鉴定将有助于更好地选择这些治疗策略的患者。最近，与肿瘤组织相邻的肝硬化肝组织的挑衅性全基因组表达谱数据揭示了可重复的基因表达特征，可能与晚期复发和存活相关。这项研究的研究人员提出，晚期复发可能代表新的原发性原发性肿瘤，而不是初始肿瘤的复发，反映出暴露于环境因素，如病毒感染，可能使肝细胞易于恶变。最近，发现5基因标记对接受手术切除的早期肝细胞癌患者具有预后意义，并且可以区分良好和不良预后亚组，即使在肿瘤>5cm的患者中也是如此。分子数据可能会影响未来的治疗决策。此外，基因组技术的利用使得能够鉴定几个在遗传和表观遗传改变，分子途径和临床特征方面不同的肝细胞癌亚组。例如，癌基因中的体细胞激活突变CTNNB1在约20-40％的肝细胞癌患者中被发现，并且显示与染色体稳定性和乙型肝炎病毒感染的缺乏有关，尽管它们与预后的关系仍不清楚在乙型肝炎病毒感染患者中，端粒长度也可能与肝细胞癌的风险和预后相关。最近的一项研究表明，乙型肝炎病毒患者血清DNA样本中相对端粒长度相关的肝细胞癌比无癌症的乙型肝炎病毒患者长50％。p53肿瘤抑制基因的突变也已被描述;这些似乎与黄曲霉毒素暴露和乙型肝炎病毒感染有关，并且与预后不良有关Ras/Raf/MAPK途径的组成型活化在肝癌发生中起重要作用。来自体外研究的证据表明，丙型肝炎病毒核心蛋白可能通过Raf-1激酶的组成型激活直接参与MAP激酶级联反应。上述数据表明肝细胞癌的几种分子变异;然而，与研究人员可以基于分子亚型个体化治疗的其他一些癌症相反，没有发现能够预测肝细胞癌靶向治疗反应的分子亚型。随机II期试验的最新发现表明，表达c-Met的肝细胞癌可能受益于MET抑制剂tivantinib的治疗;因此，这个生物学亚组需要进一步探索。然而，到目前为止，肝细胞癌遗传和分子研究的全部潜力受到阻碍，部分原因是缺乏足够的组织可用性。随着研究界继续认识到组织的关键需求，以帮助更好地理解肝细胞癌发展和进化的分子基础，并且意识到将转化研究纳入临床试验设计的重要性，这肯定在发生变化。肝细胞癌是一种复杂且固有的异质性疾病，并且由合并症混淆。近年来，在肝细胞癌的分期和管理方面取得了相当大的进步，这些进展已经改善了患者的预后，包括肝癌晚期的生存获益。尽管取得了这些成功，但仍有许多工作要做“将疗效转化为有效性。”在学术和社区环境中实施指南推荐的监测计划是非常重要的，以便在疾病的早期诊断肝细胞癌，并且可用的治疗选择在个性化的基础上使用。至关重要的是，建立综合性多学科护理是为了有效地将这些变化纳入日常临床实践中。预计肝细胞癌的分子遗传学和基因组学的最新进展将有利地影响新疗法的临床开发，预后和预测标志物的鉴定以及微血管侵袭的替代物。最后，人们越来越认识到，在未来的试验中，需要对临床试验设计和执行范式的变化进行评估和验证这些新的分子概念和新疗法。