肺癌长期以来一直是美国癌症死亡的主要原因。目前，低剂量计算机断层扫描扫描用于筛查有大量吸烟史且年龄在55至74岁之间的人群。计算机断层扫描扫描已被证实可有效降低肺癌死亡率，但计算机断层扫描确定的数百万肺结节中仍有许多未被诊断为恶性或良性。根据全国肺部筛查试验，计算机断层扫描检测到结节的个体中只有少部分被证实患有肺癌，表明假阳性率很高。因此，需要进行诊断测试，以区分恶性结节和良性结节，从而在与计算机断层扫描筛查相结合时提高诊断性能。实际上，对这些标记物的测试应该依赖于容易获得的样品，例如血浆或痰液，因为它们可能是从接受筛查的个体获得的。已经花费了巨大的努力来鉴定蛋白质，循环肿瘤细胞。
　　 血液中许多分子标记物的浓度往往非常低，因为它依赖于癌细胞的分泌，癌细胞在临床前阶段的数量很少。通常，只有分泌生物标志物的一小部分被分配给等离子体，其中所述生物标志物被在血液中的大体积稀释。这些低浓度使发现和常规检测具有挑战性。另一种策略是利用免疫系统通过产生自身抗体来检测肿瘤细胞的存在的能力。适应性免疫系统对靶肿瘤抗原的这些反应有效地扩增来自癌组织释放的微量肿瘤蛋白的信号。临床诊断肿瘤的前产生自身抗体已经观察年。因此，血液产生自身抗体可以作为一个良好的储早期检测生物标记物的。
　　 在这里报告了蛋白质组规模的首批研究之一，重点是比较肺腺癌，重度吸烟者和良性结节对照的同源样本组中的血浆产生自身抗体反应。专注于肺癌的单一亚型，以避免异质性，并使得能够排除亚型之间的变异。首先使用核酸可编程蛋白质阵列，对患有非小细胞肺癌肺腺癌亚型的患者使用无偏倚的癌症特异性抗体筛查，并使用年龄，性别和吸烟匹配的对照显示大约一万个全长人类蛋白质。在一组独立的病例和对照中进一步评估候选肺癌特异性抗体，包括具有良性肺结节的受试者。
　　 使用免疫蛋白质组学方法，在健康、重度吸烟者对照和肺癌患者中分析抗体反应。生物信息学分析揭示了与胚胎形态发生、器官发育、信号传导和丝氨酸/苏氨酸激酶途径相关的显着富集途径。通过确认抗体子集的性能使用扩展的样本集，包括具有良性结节的受试者。可区分肺癌和有吸烟史的高危对照组。肺癌患者与计算机断层扫描阳性肺结节患者产生自身抗体反应的比较揭示了相关但不同的五产生自身抗体组。还计算了所有候选抗原的敏感性和特异性，这些抗原进入验证研究，限制吸烟史为30包或更多年龄的个体的良性样本。所有五种报道的候选抗原仍然表现出高于5%的敏感性，表明它们仍然提供肺肺腺癌患者和良性对照之间的区别。虽然这些小组需要进一步验证，但它们确实提供了有关这些信息抗原的互补性的信息。进一步分析显示，产生自身抗体与肿瘤大小，分期或吸烟史无关。据知，这是首批应用免疫蛋白质组学方法鉴定特异性抗体的研究之一，这些特异性抗体可能有助于将具有计算机断层扫描阳性结节的受试者分为良性肺病和肺肺腺癌患者。为了确保在分析结果时准确估计响应，学者们还估计了与支持相关的背景每种血浆样品的试剂，在类似的研究中提供最严格的分析。
　　 有报道称标记组对肺癌的敏感性较高; 然而，这些研究使用了较不严格的研究设计和有限的样本数量。添加几个产生自身抗体标记。但是，他们用前研究对照样品的数量有限，而对吸烟史的任何信息，并被列入后续研究上的控件的信息。此外，所有上述报道的生物标志物都需要在更大的样品组中进一步独立验证。
　　 除了在蛋白质阵列筛选中鉴定的17种产生自身抗体外，还包括两种核心产生自身抗体，因为它们根据之前的几份报告在诊断肺癌方面具有优越的性能。两者都包含在被商业和现在大量人口被测试产生自身抗体的面板。有趣的是最近还确定了基底样乳腺癌对这些抗原的强烈反响。虽然在基底样乳腺癌和卵巢癌中很容易检测到产生自身抗体反应，但没有在患者队列中观察到对的特异性产生自身抗体反应。计算机断层扫描产生自身抗体是产生自身抗体。具体而言，很少有研究针对早期肺腺癌中以良性肺病作为对照样品的计算机断层扫描产生自身抗体应答。根据之前的报道，产生自身抗体在鳞状细胞肺癌和小细胞肺癌中的发生率似乎高于 肺腺癌，其中癌症随着癌症阶段的增加而增加。如所建议的，较低的产生自身抗体反应也可能是由于吸烟的影响。
　　 有兴趣找到肺肺腺癌与产生自身抗体对抗的关联。编码转导调节信号到有丝分裂原活化的蛋白激酶在一种丝氨酸-苏氨酸激酶生长因子受体信号转导通路。产生自身抗体已报告患者黑色素瘤，在其中在疾病机制中起重要作用。患有类风湿性关节炎的患者也被发现患有产生自身抗体，但这种关联正在争论之中。基因也在10%的肺肺腺癌中发生突变。这可能是的肺肺腺癌过表达促成了其产生自身抗体和疾病进展的两个层面。不幸的是，对应于来自患有产生自身抗体的患者的样品的肿瘤组织不能用于测试这种可能性。突变也可能是它引起的体液免疫反应的原因; 然而，需要进一步研究比较同一患者的蛋白质表达，突变和产生自身抗体反应，以澄清这些预测。
　　 哪些因素决定了这些体液免疫反应的发展尚不清楚。假设产生自身抗体反应与组织相应蛋白质靶标的过表达相关，产生自身抗体反应将在仅有一小部分具有过表达蛋白质的患者中以可检测水平发展。这一发现不仅表明肺肺腺癌中产生自身抗体的发展可能是蛋白质过度表达的结果，而且正交验证了这些产生自身抗体与肺肺腺癌的关联。
　　 该研究的优势包括使用来自患有非小细胞肺癌的肺腺癌亚型的患者的大量血浆样品，其主要是与吸烟者对照和具有计算机断层扫描阳性良性肺病的对照相匹配的疾病。学者们还使用高度可再现的蛋白质阵列，为无偏的高通量筛选候选产生自身抗体的，这表明与发育过程和信息的途径激酶信号。为了评估这些产生自身抗体的性能，在大样本集中使用了更多临床相关的测定，并进行了独立的盲验证。这项研究的局限性在于，没有在研究开始时将患者随机化为发现和验证集。这导致验证样本集中的更多晚期样本。早期样品的未来验证研究对于确认标记物的性能是必要的。虽然这是迄今为止最大的肺癌自身抗体研究之一，也是唯一使用计算机断层扫描筛查检测到的患者和良性对照的研究，但样本量仍然太小，无法在多变量分析中得出明确的结论。研究集中在具有肺腺癌的组织学同质人群中; 然而，未来的研究需要评估肺腺癌的亚型的产生自身抗体反应和疾病异质性，并通过其组织学亚型和分子亚型进行分层。此外，该研究还依赖于蛋白质组筛选的野生型蛋白质筛查肺癌相关抗体。由于可以获得编码具有已知癌症相关突变的蛋白质的互补克隆，因此包括这些突变也可能是有用的。
　　 总之，使用蛋白质阵列进行了产生自身抗体反应的免疫蛋白质组学筛选，并鉴定了两组产生自身抗体，它们可以潜在地区分肺癌肺腺癌患者与吸烟者对照和计算机断层扫描阳性良性肺病患者。作为一种推定的致癌基因，也被发现可以引起肺癌患者的体液免疫反应。对于这项研究，专注于具有高特异性的标志物，因此具有阳性计算机断层扫描筛查和阳性血清试验的高风险受试者应该进行更具侵入性的测试，例如针吸活组织检查，及时诊断癌症。另一方面，本研究中报道的产生自身抗体标记物的敏感性仍然有限。将来将这些标记与其他现有标记组合以创建具有更好区别特征的面板将是有用的。在未来将专注于将现有标记与面板相结合，以实现更高的灵敏度。使用突变抗原或翻译后修饰抗原的未来研究可能有助于鉴定更好的性能标记物。使用纵向样品来跟踪抗体变化也可以改善标记物性能。不同分子类型的标记的综合小组反映了生理状态的变化 从良性肺病/健康吸烟者到肺癌对于减少计算机断层扫描假阳性的影响是必要的。